研究报告

藜麦 FAD2 基因鉴定及生物信息学分析  

刘江 , 王育川 , 董艳辉* , 曹秋芬 , 吴慎杰 , 秦永军
山西农业大学生命科学学院, 太原, 030031
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2020年09月14日    接受日期: 2020年09月21日    发表日期: 2022年08月01日
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摘要

脂肪酸去饱和酶(FAD2)是植物亚油酸合成途径中的关键酶,在植物不饱和脂肪酸合成中起着重要作用。本研究基于藜麦基因组数据库,筛选得到 3 FAD2 基因成员,包含有典型的脂肪酸去饱和酶结构域。通过生物信息学分析,FAD2 蛋白等电点(pI)8.89~8.97,均属于碱性蛋白质,氨基酸序列长度在 369~382 之间,分子量范围为 44.09~44.62 kD,为亲水性蛋白,亚细胞定位于内质网中。系统进化树分析表明,藜麦 FAD2基因家族成员处于同一个亚支,与大豆的亲缘关系最近。启动子元件分析结果显示,FAD2 基因启动子含有多个参与干旱、低温、光照、抗逆以及多种激素响应的顺式作用元件和转录因子结合位点,暗示藜麦 FAD2 家族成员参与多种防御和应激反应。本研究通过生物信息学分析了 FAD2 基因家族,对进一步研究 FAD2 基因的功能提供参考。

关键词
藜麦(Chenopodium quinoa);FAD2;去饱和酶;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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